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Text File  |  1996-03-04  |  3KB  |  51 lines
  1.        Document 0640
  2.  DOCN  M9640640
  3.  TI    The human immunodeficiency virus type 1 5' packaging signal structure
  4.        affects translation but does not function as an internal ribosome entry
  5.        site structure.
  6.  DT    9604
  7.  AU    Miele G; Mouland A; Harrison GP; Cohen E; Lever AM; University of
  8.        Cambridge Department of Medicine, Addenbrooke's; Hospital, United
  9.        Kingdom.
  10.  SO    J Virol. 1996 Feb;70(2):944-51. Unique Identifier : AIDSLINE
  11.        MED/96135205
  12.  AB    The role of the RNA secondary structure in the 5' packaging signal
  13.        region of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) in initiating
  14.        translation of gag mRNA has been investigated both in vitro and in the
  15.        presence of cellular cofactors in vivo. Heat denaturation of the
  16.        structure and mutagenic deletion both lead to an increase in levels of
  17.        translated products, indicating that the structure is a significant
  18.        inhibitor of translation. The proximity of the gag AUG to the packaging
  19.        signal structure suggested that it might function as an internal
  20.        ribosome entry site. However, in both a cell-free system and eukaryotic
  21.        cells, translation will initiate at a novel upstream initiation codon
  22.        introduced within the 5' noncoding region. This codon is utilized
  23.        exclusively, resulting in gag protein products with an extra 11 amino
  24.        acids at the amino terminus, which, when expressed in T lymphocytes, are
  25.        confined intracellularly, probably because of the lack of an N-terminal
  26.        glycine myristoylation signal. Deletion of the secondary structure
  27.        abolishes gag production even in the presence of tat and rev in trans.
  28.        Using dicistronic constructs containing the HIV-1 5' leader cloned
  29.        between two heterologous open reading frames, we were unable to detect
  30.        any significant expression of the second open reading frame that would
  31.        have been supportive of an internal ribosome entry site mechanism. Using
  32.        mutant proviruses either lacking the entire packaging signal structure
  33.        region or containing the introduced upstream initiation codon in
  34.        long-term replication studies, we were unable to detect reverse
  35.        transcriptase activity in culture supernatants. The 5' packaging signal
  36.        structure of HIV-1 does not serve as an internal ribosome entry site.
  37.        The translation of gag is consistent with ribosomal scanning. However,
  38.        the packaging signal structure causes significant translational
  39.        inhibition.
  40.  DE    Amino Acid Sequence  Animal  Base Sequence  Cell Line  Codon, Initiator
  41.        Fusion Proteins, gag-pol/*GENETICS  Hela Cells  Human
  42.        HIV-1/*GENETICS/PHYSIOLOGY  Molecular Sequence Data  *Nucleic Acid
  43.        Conformation  Peptide Chain Initiation/*PHYSIOLOGY  Reticulocytes
  44.        Ribosomes/*METABOLISM  RNA, Messenger/CHEMISTRY/*GENETICS  RNA,
  45.        Viral/CHEMISTRY/*GENETICS  Structure-Activity Relationship  Support,
  46.        Non-U.S. Gov't  Transcription, Genetic  Virus Assembly  JOURNAL ARTICLE
  47.  
  48.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  49.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  50.  
  51.